* 通讯作者:Jinbo Xu, jinboxu@moleculemind.com 参考文献 [1] Joseph L Watson, David Juergens, Nathaniel R Bennett, Brian L Trippe, Jason Yim, Helen E Eisenach, Woody Ahern, Andrew J Borst, Robert J Ragotte, Lukas F Milles, et al. De novo design of protein structure and function with rfdiffusion. Nature, 620 (7976):1089–1100, 2023. [2] Martin Pacesa, Lennart Nickel, Christian Schellhaas, Joseph Schmidt, Ekaterina Pyatova, Lucas Kissling, Patrick Barendse, Jagrity Choudhury, Srajan Kapoor, Ana Alcaraz-Serna, et al. One-shot design of functional protein binders with bindcraft. Nature, 646 (8084):483–492, 2025. [3] Vinicius Zambaldi, David La, Alexander E Chu, Harshnira Patani, Amy E Danson, Tristan OC Kwan, Thomas Frerix, Rosalia G Schneider, David Saxton, Ashok Thillaisundaram, et al. De novo design of high-affinity protein binders with alphaproteo. arXiv preprint arXiv:2409.08022, 2024. [4] Chai Discovery Team, Jacques Boitreaud, Jack Dent, Danny Geisz, Matthew McPartlon, Joshua Meier, Zhuoran Qiao, Alex Rogozhnikov, Nathan Rollins, Paul Wollenhaupt, et al. Zero-shot antibody design in a 24-well plate. bioRxiv, pages 2025–07, 2025. [5] Luis S Mille-Fragoso, John N Wang, Claudia L Driscoll, Haoyu Dai, Talal Widatalla, Xiaowei Zhang, Brian L Hie, and Xiaojing J Gao. Efficient generation of epitope-targeted de novo antibodies with germinal. bioRxiv, 2025. [6] Hannes Stark, Felix Faltings, Min Gyu Choi, Yuxin Xie, Eunsu Hur, Timothy O’Donnell, Anton Bushuiev, Talip Uçar, Saro Passaro, Weian Mao, et al. Boltzgen: Toward universal binder design. bioRxiv, pages 2025–11, 2025. [7] BioGeometry Team and Jian Tang. Rapid de novo antibody design with geoflow-v3. bioRxiv, pages 2025–10, 2025. [8] Sheng Xu, Qiantai Feng, Lifeng Qiao, Hao Wu, Tao Shen, Yu Cheng, Shuangjia Zheng, and Siqi Sun. Foldbench: An all-atom benchmark for biomolecular structure prediction. bioRxiv, pages 2025–05, 2025. [9] Josh Abramson, Jonas Adler, Jack Dunger, Richard Evans, Tim Green, Alexander Pritzel, Olaf Ronneberger, Lindsay Willmore, Andrew J Ballard, Joshua Bambrick, et al. Accurate structure prediction of biomolecular interactions with alphafold 3. Nature, 630 (8016):493–500, 2024. [10] Helen M Berman, John Westbrook, Zukang Feng, Gary Gilliland, Talapady N Bhat, Helge Weissig, Ilya N Shindyalov, and Philip E Bourne. The protein data bank. Nucleic Acids Research, 28 (1):235–242, 2000. [11] Claudio Mirabello and Björn Wallner. Dockq v2: improved automatic quality measure for protein multimers, nucleic acids, and small molecules. Bioinformatics, 40 (10):btae586, 2024. [12] Saro Passaro, Gabriele Corso, Jeremy Wohlwend, Mateo Reveiz, S. Thaler, Vignesh Ram Somnath, Noah Getz, Tally Portnoi, J. Roy, Hannes Stark, D. Kwabi-Addo, Dominique Beaini, Tommi Jaakkola, and Regina Barzilay. Boltz-2: Towards accurate and efficient binding affinity prediction. bioRxiv, pages 2025–06, 2025. [13] ByteDance Seed. Protenix-v2: Broadening the reach of structure prediction and biomolecular design. 2025. [14] ByteDance AML AI4Science Team, Xinshi Chen, Yuxuan Zhang, Chan Lu, Wenzhi Ma, Jiaqi Guan, Chengyue Gong, et al. Protenix—advancing structure prediction through a comprehensive alphafold 3 reproduction. bioRxiv, pages 2025–01, 2025. [15] Salvatore Candido et al. Language modeling materializes a world model of protein biology, 2026. URL https://github.com/biohub/esm. Biohub preprint. [16] Ivan Anishchenko, Samuel J Pellock, Tamuka M Chidyausiku, Theresa A Ramelot, Sergey Ovchinnikov, Jingzhou Hao, Khushboo Bafna, Christoffer Norn, Alex Kang, Asim K Bera, et al. De novo protein design by deep network hallucination. Nature, 600 (7889):547–552, 2021. 附录 A 设计 VHH 序列针对已知抗体数据库的 CDR 相似性分析 为评估设计序列相对于已知抗体序列的新颖性,我们对 338 个 VHH 序列进行了 CDR 相似性分析,涵盖 11 个靶标系统,并额外检查了每个系统中亲和力最高的 VHH 候选物。
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10、世界杯拖后腿!法国亿级天才彻底迷失,全场高光唯独他低迷
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国务院关于同意将山东省潍坊市列为国家历史文化名城的批复 国函〔2026〕80号 山东省人民政府: 你省关于申报潍坊市为国家历史文化名城的请示收悉。
北大校史馆 先从一件趣事说起——二十多年前,若干有志于学的年轻人,编写了一本记录各自在北大旁听或偷听经历的图书,邀我作序,这让我喜忧参半:“喜的是书中所体现的顽强意志与旺盛的生命力,也包括其中折射出来的很有‘亲和感’的北大形象。
7、重庆发布高温红色预警 21个区县今日最高气温将达40℃至42℃
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日本紧急求助电话:110(警察)、119(消防、急救)、118(海上事故、海难) 外交部全球领事保护与服务应急热线(24小时): +86-10-12308 +86-10-65612308 驻日本大使馆领事保护与协助电话:+81-3-6450-2195 驻大阪总领馆领事保护与协助电话:+81-6-6445-9427 驻福冈总领馆领事保护与协助电话:+81-92-753-6483 驻札幌总领馆领事保护与协助电话:+81-11-513-5335 驻长崎总领馆领事保护与协助电话:+81-95-849-3311 驻名古屋总领馆领事保护与协助电话:+81-52-932-1036 驻新潟总领馆领事保护与协助电话:+81-25-228-8888 来源:中国新闻网 编辑 唐维灿 责编 王 萌 审核 杨明荣 点亮♡,持续关注!近日,2026天府科学家创新发展大会在成都举办,中国工程院院士、清洁生产专家段宁提出实时微观化学过程AI技术。
8、大张家界国际旅游区宣传片、品牌形象LOGO、宣传口号发布
无独有偶 11岁女孩追星遇“假明星” 被诈骗7.4万余元 2026年6月12日15时许,四川遂宁市公安局船山区分局介福路派出所接到辖区居民吴女士报警,称家中银行卡无故少了2万多元,怀疑遭遇盗刷。
中国驻日本大使馆再次提醒在日本中国公民提高防范意识、注意交通安全。
研究团队一共设计并合成了100 个优化肽,并把它们拿去做系统的体外测试,覆盖11 种临床相关病原菌,包括耐药菌株。
上海本地情况: “低流行”是啥意思?公众如何应对?日前,记者连线国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏教授团队获悉,从国家传染病医学中心检测数据看,大众不要恐慌,但也不要轻视,戴口罩、勤洗手等传统防护方法依然有效,贵在科学防护与坚持,一旦确诊及时就医——因为当前新冠也有明确的诊断方法与药物,因而不用过度焦虑。
用户本届世界杯唯一攻破过西班牙大门的球队,官宣换帅 为反超梅西!金球奖最新概率:凯恩第1亚马尔姆巴佩位列二三赠送39岁瓦尔迪本可重返英格兰,却心向塞维利亚开启西甲新冒险旭烈兀的地盘比别人还大,还执着于山西的农户,究竟是怎么回事?
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用户2030年世界杯由西葡摩三国联办,决赛落户谁家?因凡蒂诺寻求连任,决赛地的选择将影响投票 为政务服务加码 金塔目建设按下“快进键”赠送利物浦接触摩纳哥询价阿克利乌什 巴黎3400万镑报价已遭拒点赞最棒
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当下,成都正将“数字经济对外合作”作为一扇重要窗口,将APEC机遇变成发展增量。我要发布>>
人大代表、政协委员和各界群众20余人旁听了庭审。我要发布>>
第三,虽然初步表达和特异性测量令人鼓舞,全面的治疗性可开发性评估 —— 包括长期稳定性、聚集抗性、免疫原性和体内药代动力学分析 —— 超出了本工作的范围。我要发布>>
既然黄英贤也表了态,“通过对话接触妥处矛盾分歧”,我看,不要总窝在“一小撮”为妙!上海天气:28-36℃,多云,午后局部地区阴短时有阵雨或雷雨 谈天 今天“大暑”,俗话说“小暑不算热,大暑正伏天”。我要发布>>
一多喝水:及时补充因大量出汗而流失的电解质; 二多通风:常呆在空调房中易出现头晕、鼻塞等症状,需及时开窗,保持室内外空气流通; 三多休息:保持6至8小时的充足睡眠,有条件可增加半小时左右的午休时间,增强免疫力。我要发布>>
然而,在药物发现与计算化学的真实工作流里,科学家还要回答第二个同样关键的问题:分子如何运动 —— 配体在结合口袋中如何涨落、蛋白主链与侧链如何协同形变,乃至配体沿何路径解离至溶剂。我要发布>>
其中,全国税收收入约9.79万亿元,同比增长5.3%。我要发布>>
赛后颁奖活动,西班牙中场罗德里荣膺世界杯金球奖。我要发布>>
【警方通报16岁高中生被刺死案】内蒙古警方通报:案发地不属于涉黄场所;犯罪嫌疑人张某无固定职业,并非场所保安。我要发布>>
那句“你相信光吗?”也早已超越剧情,成为一代人内心深处的精神暗号。我要发布>>